В мире, где сладости стали не просто лакомством, а источником жизненной силы и магии, существует особая категория людей — Кондитеры. Они способны превращать сахар в мощные артефакты и оружие, а их главными врагами являются Кариесные монстры — порождения гниения и распада, пожирающие всё сладкое и несущие хаос. Главный герой, молодой парень по имени Ацуши, с детства мечтал стать великим Кондитером, но его талант оказался необычным: он не просто создаёт сладости, а способен чувствовать их душу, буквально слыша, как сахар «плачет» или «смеётся». Однако его мечты рушатся, когда во время нападения могущественного Кариеса он теряет свою лучшую подругу, которая жертвует собой, чтобы спасти его. Одержимый чувством вины, Ацуши клянётся уничтожить всех монстров, но для этого ему придётся вступить в элитную Академию Сладкой Алхимии, где учатся самые одарённые Кондитеры.
В академии Ацуши сталкивается с жестокой реальностью: его уникальный дар считают проклятием, а однокурсники презирают за слабость. Единственным, кто верит в него, становится загадочный преподаватель — бывший легендарный Кондитер, который когда-то был близок к созданию абсолютного лекарства от Кариеса, но потерпел неудачу и теперь скрывает тёмный секрет. Вместе с группой изгоев — дерзкой девушкой, управляющей леденцами-мечами, молчаливым парнем, чьи шоколадные доспехи непробиваемы, и гением-отличником, который использует карамель для создания ловушек, — Ацуши начинает постигать истинную природу Кариеса. Оказывается, монстры не просто случайные порождения: они — результат человеческих грехов и сожалений, превращённых в гниль. Чем глубже герои погружаются в тайны академии, тем яснее становится, что их учитель скрывает правду о происхождении Кариеса, а сама школа — лишь полигон для экспериментов по созданию идеального оружия. Ацуши предстоит понять, что сладость может быть не только спасением, но и проклятием, а его дар слышать сахар — ключ к разгадке, которая изменит весь мир.