Третий сезон начинается там, где второй оставил зрителей в полном недоумении и ужасе. После событий в лаборатории «Генезис» и гибели доктора Моримуры, Кадзуки Синдо, наконец, снявший «Ошейник Изгоя», оказывается не просто свободным, а превращается в главную мишень для всего мира. Его уникальная способность «Поглощение» вышла из-под контроля, и теперь он не просто копит силу других Отвергнутых, а начинает необратимо стирать их сущности. Правительство, напуганное угрозой появления нового бога, объявляет Кадзуки «Объектом Полной Ликвидации». В ход идут не только элитные отряды, но и спецподразделения с экспериментальным оружием, способным подавлять даже самые сильные дары. Параллельно раскрывается тайна происхождения самих Отвергнутых: они — не ошибка эволюции, а целенаправленный проект по созданию живого оружия, и Кадзуки — его финальная, идеальная версия. Старые союзники, включая Айку и Кендзи, расходятся во мнениях: одни хотят спасти друга, другие — уничтожить, пока он не уничтожил их всех.
В хаосе охоты появляется загадочная организация «Серая Зона», состоящая из Отвергнутых первого поколения, которые десятилетиями скрывались в тени. Их лидер, бессмертный старик по имени Дзюнъитиро, утверждает, что знает способ обратить процесс Поглощения вспять, но для этого Кадзуки должен добровольно отдать свою силу, фактически перестав существовать как Отвергнутый. Айка, разрываясь между любовью к Кадзуки и долгом перед человечеством, пытается найти третий путь, вступая в опасный союз с «Серой Зоной». Тем временем Кендзи, потерявший веру в систему, срывает «Ошейник» и начинает собственную войну против правительства, превращаясь в террориста. Кульминацией сезона становится битва в небесном городе-крепости «Амацуками», где Кадзуки, балансируя на грани безумия, должен сделать выбор: стать богом, уничтожившим всё, или человеком, потерявшим всё. Финал оставляет зрителя с шокирующим открытием: Поглощение не стирает души, а запирает их внутри Кадзуки, и голоса всех поглощённых начинают говорить с ним в унисон, предлагая свою версию спасения мира.
